大曲在酿制镇江香醋中起到极其重要的作用。它的主要功用是作为糖化发酵剂，同时它的分解蛋白质、产酯等功能与镇江香醋特有的风味、特色有着密切的关系。镇江香醋制造麦曲一般在阳历7月至8月间，此时正当荷花盛开，莲蓬结子的高温季节，所以制成的曲称为"伏曲"。 大曲经不少于8个月的贮存后才投入使用。大曲（麦曲）是由小麦、大麦和碗豆为原料经过大小十几道工序制作而成。 小麦含有丰富的霉菌繁殖所需要的营养成分，并具有适当的粘着力，特别适合大曲的生产。如使用大麦，必须添加适量的豆类以补足营养成分和粘着力。镇江香醋大曲使用生料制曲，在贮存期内，镇江地区的温度、湿度、微生物条件与生料发生复杂的生化反应，曲块上自然形成多种微生物共存体系及复杂酶系。